MIŠ delavnice navadno potekajo enkrat tedensko po 2 šolski uri, je pa oblika izvajanja delavnic odvisna tudi od posamezne šole ali organizacije, preko katere dejavnost poteka. Skupine so različno velike, odvisno od povpraševanja na posameznih šolah (večinoma od 5 pa do 15 udeležencev).
Poleg 3-5 MIŠ srečanj, ki se odvijejo v posameznem šolskem letu ter tedenskih srečanj posameznih skupin, MIŠ organizira tudi dodatna izobraževanja, obiske ŠILA predstav ter druge oblike podpore mentoricam ter mentorjem in skupinam.
Ključni partnerji za delovanje programa so osnovne šole in nevladne organizacije, kjer se vzpostavijo skupine.